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PROTAC 蛋白降解技术突破不可成药靶点的新药策略


PROTAC 技术作为全新药物模式,不只是抑制蛋白活性,而是介导靶蛋白泛素化标记,促使致病蛋白被细胞降解清除,攻克传统小分子难以作用的靶点。

传统小分子药物大多工作逻辑是 “抑制”:药物分子结合目标蛋白活性位点,阻挡蛋白发挥功能。但人类疾病当中,大量致病蛋白缺少合适的小分子结合口袋,没有明显活性结合位点,被称作不可成药靶点。这部分靶点占据人类致病蛋白很大比例,传统药物手段很难干预。PROTAC 蛋白降解技术的诞生,跳出抑制蛋白活性的固有思维,借助细胞本身蛋白质回收系统,直接把致病蛋白彻底清除。

PROTAC 全称蛋白降解靶向嵌合体,分子结构是三段式嵌合分子:一端结合需要清除的靶蛋白,另一端结合 E3 泛素连接酶,中间依靠连接链把两部分连接在一起。当 PROTAC 分子进入细胞,会同时抓住靶蛋白与 E3 泛素连接酶,拉近二者空间距离。E3 酶就会给靶蛋白打上泛素标签。被泛素标记后的靶蛋白,会被细胞内部蛋白酶体识别捕获,最终被分解成氨基酸碎片。

和传统小分子抑制剂相比,PROTAC 拥有独特技术优势。传统抑制剂需要持续高浓度占据蛋白活性位点才能起效;PROTAC 属于事件驱动型药物,分子完成一次降解工作之后,可以脱离,继续循环介导下一个靶蛋白降解,具备催化特性,较低剂量就可以发挥药效。同时 PROTAC 可以作用蛋白非活性区域,哪怕靶点没有催化活性口袋,只要存在可以结合的结构区域,就有机会实现降解,拓展药物靶点范围。

肿瘤领域是 PROTAC 研发最火热赛道。众多肿瘤驱动蛋白,很难用小分子抑制,PROTAC 可以针对这类致癌蛋白开展药物开发。不仅如此,对于已经产生耐药突变的蛋白,部分 PROTAC 依旧可以识别突变蛋白完成降解,有望解决靶向药耐药难题。除肿瘤以外,神经退行性疾病、自身免疫疾病领域,也有大量 PROTAC 科研项目推进,降解致病蓄积蛋白,干预疾病进程。

但 PROTAC 药物研发同样存在重重阻碍。首先分子量大,相比于普通小分子,PROTAC 嵌合分子体积更大,会带来水溶性差、细胞膜穿透能力弱、体内药代动力学不理想等问题,制约口服给药开发。其次,人体 E3 泛素连接酶种类有限,可供药物利用的 E3 酶选择不多。脱靶降解风险也需要重视,PROTAC 分子有可能带动非目标蛋白发生泛素降解,产生未知毒性。另外连接链的长度、化学结构,会极大影响 PROTAC 分子活性,连接链筛选优化实验工作量巨大。

PROTAC 蛋白降解技术泛素‑蛋白酶体作用机制科研示意图

全球 PROTAC 领域已经从基础科研走向临床阶段,多个候选药物已经进入临床一期、二期试验。不过绝大多数候选分子依旧集中在肿瘤适应症,距离大规模临床普及还有较长距离。化学结构优化、提升成药性、拓展可用 E3 连接酶,是行业接下来重点攻关方向。

综合来看,PROTAC 改写新药研发的底层逻辑,把药物逻辑从 “抑制蛋白功能” 升级为 “清除致病蛋白”,为大量过去无药可治的靶点打开窗口。随着化学合成、药物递送技术持续迭代,蛋白降解药物有望成为下一代药物研发重要支柱。

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