流式细胞术广泛用于分析细胞表面和细胞内分子的表达、鉴定并确定异质细胞群中的不同细胞类型、评估分离亚群的纯度以及分析细胞大小和容积。
主要用于测定荧光标记的抗体检测蛋白产生的荧光强度，或结合了特定细胞分子的配体，如碘化丙啶与 DNA 的结合。
其染色过程包括从细胞培养物或组织样品制备单细胞悬液。然后将获得的细胞培养在包含未标记或荧光标记抗体的试管或多孔板中，再用流式细胞仪分析。
流式细胞仪主要有两型：
临床型（又称：小型机、台式机）和综合型（又称：大型机、分析型）。BECKMAN-COULTER公司最新产品为EPICS ALTRA和EPICS XL/XL-MCL，B-D公司最新产品为FACS Vantage和FACS Calibur。EPICS XL/XL-MCL和FACS Calibur是临床型；EPICS ALTRA和 FACS Vantage是综合型，除具备检测分析功能外，还具有细胞分选功能，多用于科学研究。
流式细胞仪主要技术指标
1.流式细胞仪的分析速度：
一般流式细胞仪每秒检测1000～5000个细胞，大型机可达每秒上万个细胞；
2.式细胞仪的荧光检测灵敏度：
一般能测出单个细胞上<600个荧光分子，两个细胞间的荧光差＞5%即可区分；
3.前向角散射（FSC）光检测灵敏度：
前向角散射（FSC）反映被测细胞的大小，一般流式细胞仪能够测量到0.2μm～0.5μm；
4.流式细胞仪的分辨率：
通常用变异系数CV值来表示，一般流式细胞仪能够达到<2.0%，这也是测量标本前用荧光微球调整仪器时要求必须达到的；
5.流式细胞仪的分选速度：
一般流式细胞仪分选速度＞1000个/秒，分选细胞纯度可达99%以上；
流式细胞仪：射流
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